Các hợp chất tự nhiên là thuốc chống vi rút nguyên mẫu và là nguồn nguyên liệu để phát triển các loại thuốc mới thông qua quá trình tổng hợp, hóa dược và tối ưu hóa qua nhiều thập kỷ sau khi được phát hiện. Một cách tiếp cận sử dụng phân tích tính toán là xu hướng mới để thiết kế thuốc hợp lý nhằm xác định và phát triển các thuốc chống vi-rút có nguồn gốc từ các hợp chất tự nhiên. 

Nghiên cứu được thực hiện với mục tiêu xác định các nguyên mẫu hợp chất tự nhiên nhằm hỗ trợ nỗ lực tiến tới tìm kiếm các chất ức chế sao chép Betacoronavirus phổ rộng an toàn, hiệu quả và giá cả phải chăng bằng cách nhắm mục tiêu RNA 2′- O -methyltransferase (2′-O-MTase). Machaeriol RS-1 và RS-2 đã được xác định bằng cách sử dụng phương pháp tiếp cận tin học đã nêu trước đó để sàng lọc đầu tiên các nguyên mẫu sản phẩm tự nhiên, sau đó là tổng hợp theo hướng in silico. Cả hai phân tử đều dựa trên một nhóm sản phẩm tự nhiên quý hiếm. Các machaeriol được phân lập từ chi Machaerium, đặc hữu của Amazonia, đã ức chế SARS-CoV-2 2′-O-MTase mạnh hơn so với đối chứng dương tính - Sinefungin, và trong mô hình  in silico cho thấy sự khác biệt về phân tử tương tác. 

Báo cáo này nhấn mạnh tiềm năng của sàng lọc dựa trên tính toán để tận dụng các thư viện sản phẩm tự nhiên và cải thiện hiệu quả của quá trình phân lập hoặc phát triển chất tổng hợp tương tự .

Nguồn: https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.jnatprod.3c00875

George S. Hanna, Menny M. Benjamin, Yeun-Mun Choo, Ramyani De, Raymond F. Schinazi, Sarah E. Nielson, Joan M. Hevel, and Mark T. Hamann, 2024. Informatics and Computational Approaches for the Discovery and Optimization of Natural Product-Inspired Inhibitors of the SARS-CoV-2 2′-O-Methyltransferase. Journal of Natural Products, 87, 2, 217–227.

Người dịch: Nguyễn Thị Thúy An

Người duyệt: Nguyễn Thị Thùy Trang